噴灌機關鍵是防堵塞。選擇合適的過濾器是噴灌機成功的先決條件。常用的過濾器有砂石分離器、介質過濾器、網式過濾器和疊片過濾器。前兩者做初級過濾用，后兩者做二級過濾用。過濾器有很多的規格，選擇什么過濾器及其組合主要由水質決定。這是較專業的問題，最好由專業人士設計和選擇。
　　微滴灌系統通過灌水器（微噴頭或滴頭）來調節流量，灌水器的流道直徑很小，極易被灌溉水中的物理和化學雜質堵塞，因此，為防止灌水器堵塞和投資浪費，在微滴灌系統中必須配備合適的過濾器。在選擇過濾器之前，應首先確定一下因素：
　　1、 弄清楚灌溉水中有那些雜質。通過水質化驗可獲得雜質的粒徑、物理特性、濃度等指標，這些指標將決定所選過濾器型及其維護方式。
　　2、 確定所選灌水器的流道直徑，將用此直徑選定過濾器的過濾能力。
　　3、 確定灌溉系統的峰值流量，將用此流量選擇過濾器的過濾容量。
　　4、 進行造價比較。若選定了一種過濾器，但必須把自動控制和維護管理費用加進總造價中，進行經濟比較后選擇合適的過濾系統。
　　5、 過濾器的目數即過濾器的過濾能力取決于灌水器的流道直徑，網式和疊片過濾器的過濾能力通常以目數表示，而砂石過濾器的過濾能力則用過濾砂的標號表示。